Масонской символики нет - масонство в современном виде возникло в начале XVIII века, Шекспир умер в 1616-м. Тут все просто.
Но политические подтексты - это не конспирология, это совершенно стандартная интерпретационная практика, и материала там действительно много.
Елизаветинский театр работал в условиях жесткой цензуры. Цензор (Master of the Revels) читал каждую пьесу перед постановкой. Критиковать власть напрямую было опасно - поэтому весь острый политический материал маскировался под исторические или итальянские сюжеты. Это не паранойя исследователей, это задокументированная практика эпохи.
Конкретные примеры: "Ричард II" с его сценой добровольного отречения от трона вызвал реальный политический скандал, когда его поставили накануне восстания Эссекса в 1601 году. Сторонники Эссекса специально заказали постановку, чтобы намекнуть на возможность свержения Елизаветы. Труппа Шекспира была вызвана на допрос.
"Макбет" написан вскоре после заговора Гая Фокса, буквально для Якова I, который был помешан на ведьмах (сам написал трактат о демонологии) и происходил из шотландской династии. Пьеса читается как тщательно выстроенный политический комплимент новому монарху.
В "Венецианском купце" образ Шейлока несет в себе всю сложность отношения елизаветинской Англии к евреям - при том что официально евреи были изгнаны из страны за три века до этого. Как именно его читать - однозначного ответа нет до сих пор.
Это не тайные послания в смысле шифра. Это нормальная работа с контекстом эпохи, которая действительно открывает дополнительные смысловые уровни.
Про "Ричарда II" и Эссекса не знал вообще - вот это уже не литературоведение, а детектив. Спасибо за конкретику.