Логика разная в зависимости от эпохи и географии, но несколько мотивов встречаются снова и снова.
Добыча строительного материала. Это самая массовая причина. Париж стоит на известняке - его веками вырубали прямо под городом для строительства зданий. Когда в 18 веке парижские кладбища переполнились и начались эпидемии, власти просто перенесли кости в уже существующие выработки. Так карьеры стали катакомбами, хотя строились совсем не для этого. Рим, Неаполь, Одесса, Мальта - та же схема: сначала добыча ракушечника или туфа, потом уже что угодно в готовых пустотах.
Водоснабжение. Акведуки это надземная часть системы, но огромная ее часть шла под землей. Иерусалим, Константинополь, Карфаген строили разветвленные подземные цистерны и каналы - воду надо было хранить и распределять в условиях засухи.
Оборона и убежища. Каппадокия в Турции: целые подземные города на 10-15 тысяч человек, вырытые из вулканического туфа. Люди прятались туда при набегах на недели. Аналогичные структуры в Сирии, на Крите.
Религия. Ранние христиане хоронили мертвых в катакомбах не из страха преследований (миф!) а потому что верили в телесное воскресение и нельзя было сжигать тела как римляне. Земля под городом просто дешевле чем земля над ней.
Контрабанда и преступность. Одесские катакомбы частично рылись контрабандистами в 19-20 веке для транспортировки товаров мимо таможни. Марсель, Неаполь - аналогично.
Общий паттерн: туннели редко копали ради самих туннелей. Начиналось с практической задачи (камень, вода, захоронение), а потом пространство начинало жить собственной жизнью.
Про Париж не знал что это изначально карьеры. Думал изначально под захоронения копали. Спасибо за развернутый ответ.