Отпускные за очередной отпуск должны выплатить за три календарных дня до его начала - то есть до начала самого очередного отпуска, а не до начала учебного. Это прямо следует из ст. 136 ТК РФ.

По расчетному периоду. Учебный отпуск включается в расчетный период для исчисления среднего заработка, но дни учебного отпуска и выплаченный за них средний заработок из расчета исключаются (Постановление Правительства №922, п. 5). То есть эти дни "вырезают" из расчета - они не портят тебе средний, но и не улучшают.

Если хочешь максимально корректный расчет, попроси бухгалтерию показать тебе расчетный листок до выплаты и проверь что дни учебного отпуска не вошли в числитель и знаменатель формулы среднего.