Разберем по уровням организации, это поможет структурировать ответ на зачете.

Микроорганизмы (невидимые глазу)

Постоянная микробиота человека - около 39 триллионов клеток бактерий, что сопоставимо с количеством собственных клеток тела. Кишечник - Bacteroides, Firmicutes, Bifidobacterium. Кожа - Staphylococcus epidermidis, Cutibacterium acnes. Рот - более 700 видов, Streptococcus mutans главный виновник кариеса.

В воздухе жилого помещения постоянно присутствуют споры плесневых грибов (Aspergillus, Cladosporium, Penicillium), вирусы в аэрозолях, пылевые клещи Dermatophagoides - не видны, но их фекалии главная причина бытовой аллергии.

В воде - хлорированной почти ничего, в природной - Giardia, Cryptosporidium, Legionella в теплых водопроводных системах.

Макроорганизмы (видимые или ощущаемые)

Постоянные спутники: кошки, собаки, грызуны в городской среде, птицы. Все они резервуары зоонозных инфекций (токсоплазма от кошек, лептоспироз от крыс).

Насекомые: постельные клопы возвращаются в города, тараканы, комары как переносчики (в России актуальны как переносчики дирофиляриоза), иксодовые клещи в лесопарках.

Растения и грибы: не организмы в классическом смысле взаимодействия, но споры грибов и пыльца растений постоянно в воздухе и вызывают иммунный ответ.

Для зачета ключевые термины: симбиоз, комменсализм, паразитизм, мутуализм, резидентная и транзиторная микробиота.

Добавлю про то что часто забывают. Демодекс - микроскопический клещ, живет в волосяных фолликулах и сальных железах лица примерно у 80% взрослых людей. Абсолютно нормально, патологию вызывает только при размножении сверх нормы. Большинство людей понятия не имеют что таскают его всю жизнь.