Там несколько слоев.
Исторический: Японцы долго жили в условиях жестких пищевых ограничений (буддийские запреты на мясо длились больше тысячи лет, островная изоляция, регулярный голод). Когда еда - это то, чем рискуешь, ее начинаешь ценить иначе. Культура внимания к блюду формировалась веками.
Философский: Понятие "итадакимас" перед едой - это не просто "приятного аппетита". Это благодарность всей цепочке: животному, земле, повару, продавцу. Еда встроена в синтоистское и буддийское мироощущение как акт связи с миром.
Эстетический: В японской культуре есть понятие "моно-но аварэ" - восприятие мимолетности вещей как источника красоты. Еда идеально под это подходит: она исчезает, ее нельзя сохранить, каждый прием пищи неповторим. Отсюда медитативное отношение к вкусу.
В медиа это все усиливается - авторы аниме используют сцены с едой как быстрый эмоциональный якорь. Зрителю не надо объяснять, что персонаж счастлив - достаточно показать как он ест тарелку домашнего рамена.
Про "итадакимас" кстати в западных переводах аниме почти никогда нормально не переводят, просто "кушаем" или вообще убирают. А там целый пласт смыслов.