Несколько причин, и они пересекаются.
Психология восприятия. Синий - самый "безопасный" цвет в маркетинге. Исследования (Labrecque & Milne, 2012, Journal of the Academy of Marketing Science) показали, что синий вызывает ассоциации с доверием, надежностью и компетентностью. Для платформы, которая просит тебя загрузить личные данные, фото семьи и переписку, это критично.
Физиология зрения. Колбочки в сетчатке глаза наименее чувствительны к синему спектру. Парадоксально, это плюс. Синий фон и акценты меньше утомляют глаза при длительном использовании. Красный и желтый при том же времени экспозиции вызывают визуальное утомление быстрее.
Про Цукерберга ты почти попал. Марк Цукерберг действительно страдает красно-зеленым дальтонизмом (дейтераномалия). В интервью New Yorker (2010) он сказал: "Blue is the richest color for me. I can see all of blue." Так что выбор цвета Facebook - буквально личное ограничение основателя. А дальше Facebook задал тренд, и многие стартапы 2006-2012 годов копировали его визуальный язык.
Культурная универсальность. Синий - единственный цвет, который позитивно воспринимается практически во всех культурах. Красный в Китае означает удачу, а на Западе опасность. Белый в Азии ассоциируется с трауром. Зеленый в некоторых культурах имеет религиозную коннотацию. С синим таких проблем нет. Для глобальных платформ это важный фактор.
Технический аргумент из ранних 2000-х. Веб-безопасная палитра (216 цветов, которые одинаково отображались на всех мониторах) содержала непропорционально много оттенков синего. Дизайнеры ранних сайтов работали в этих ограничениях, и привычка закрепилась.