Это ключевая точка деградации Тони. Он убивает Мэла не из стратегического расчета, а потому что Мэл предал его в самом болезненном месте - увел Элвиру. Тони к этому моменту уже давно принимает решения не головой, а из ранимого эго кубинца, который поднялся из грязи и теперь не терпит унижений.

Де Пальма и Стоун намеренно выстраивают арку так: каждое "иррациональное" действие Тони логично внутри его искаженной системы ценностей. Лояльность и уважение для него важнее денег. Мэл украл жену - предал. Точка. Что потеряет бизнес - не важно, потому что Тони уже не бизнесмен, он наркоман с манией величия.

Кокаин тут не метафора, а буквальный сюжетный механизм: сцена с горой кокса перед этим эпизодом показывает что Тони физически уже неспособен на рациональный анализ последствий.

Тони не тупой - он сломан. Разница принципиальная. Умный расчетливый Тони из первой трети фильма умер примерно в середине. То что ты видишь дальше - человек который действует на автопилоте обиды и паранойи. Мэл это просто первая крупная жертва этого автопилота.

Плюс там ведь есть и практический мотив который часто упускают. Мэл знал слишком много. Он был посредником с Сосой, знал структуру операции, знал деньги. Человек который тебя кинул с бабой и при этом держит на тебя компромат - это двойная угроза. Тони мог рассуждать (в своей кривой логике) что Мэл рано или поздно сдаст его ради самосохранения. Убить проще.