Во-первых, в Библии вообще нигде не написано, что Адам и Ева были белыми. Это народное заблуждение, основанное на европейской живописи эпохи Возрождения - итальянские художники рисовали библейских персонажей похожими на себя. Исторически люди с Ближнего Востока - смуглые, ближе к арабской внешности.
Во-вторых, с богословской точки зрения ответ простой: генетическое разнообразие. Если допустить, что все человечество происходит от одной пары, то эта пара должна была нести в своем геноме весь потенциал для всех возможных фенотипов. Меланин, разрез глаз, форма черепа - все это кодируется относительно небольшим количеством генов. Популяционная генетика не запрещает такой сценарий, просто для него нужен очень длительный период изоляции разных групп.
Наука, кстати, предполагает что все современные люди происходят от относительно небольшой группы homo sapiens из Африки. Так что с точки зрения эволюции ответ как раз обратный вашему вопросу: первые люди были темнокожими, а бледная кожа - поздняя адаптация к северному климату.
Про африканское происхождение - это сильный поворот. Получается вопрос надо переформулировать с точностью до наоборот. Спасибо.