Миллион лет - это мгновение по космическим меркам. С Юпитером за такой срок не случится практически ничего заметного.
По пунктам:
Орбита: Останется стабильной. Юпитер вращается вокруг Солнца уже 4.5 миллиарда лет и будет продолжать еще миллиарды. Миллион лет - это всего 84 тысячи оборотов вокруг Солнца для него.
Атмосфера: Большое красное пятно - интересный вопрос. Оно существует минимум 350 лет (столько наблюдаем) и постепенно уменьшается. За миллион лет оно скорее всего исчезнет и появится заново много раз - это просто гигантский шторм.
Размер: Юпитер очень медленно сжимается и остывает. Выделяет больше тепла чем получает от Солнца. Но за миллион лет сжатие будет ничтожным.
Спутники: Ио постепенно приближается к Юпитеру из-за приливных сил. За миллион лет сместится на несколько километров. Европа и Ганимед тоже слегка изменят орбиты.
Вот через 5-7 миллиардов лет когда Солнце станет красным гигантом - там уже интереснее. Юпитер не сгорит (слишком далеко) но потеряет часть атмосферы от солнечного ветра и нагреется. Его ледяные спутники растают.
Теоретически да, но это займет миллиарды лет. Скорее ее разорвет приливными силами раньше - получится кольцо как у Сатурна
Про Ио интересно, не знал что она приближается. А она может упасть на Юпитер?